La organización de los Juegos Deportivos Universitarios, a cargo de las universidades privadas desde 2015, reúne a deportistas de ocho centros de educación superior que compiten anualmente en natación, tenis de mesa, ajedrez, fútbol, básquetbol y voleibol. Desde su creación en 1990, la UPSA es una de las principales protagonistas y ha obtenido los primeros lugares en diversas disciplinas.
En cada versión de los Juegos Universitarios, que se realizan desde 1986, la UPSA es representada por estudiantes de diferentes carreras.